Het IJsselmeergebied is in zijn geheel van grote waarde voor de natuur. Het gebied is rijk aan voedsel voor tal van vogelsoorten die er het jaar rond verblijven of tijdelijk op bezoek komen. Zo vormen de wateren van het IJsselmeergebied ook een vitale schakel in de levenscyclus van meerdere trekvogelsoorten.

IJsselmeer, Markermeer, Ketelmeer, Zwarte meer en Randmeren vormen elk apart een compleet systeem van groot open water, waterbodem en oevers. In bepaalde delen van een meer kan de natuurwaarde groter zijn dan elders, maar die rijkere delen staan niet los van de rest van dat water. Bovendien verblijven vogels onder invloed van wisselende windrichtingen nooit altijd op dezelfde plek.